Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms