Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PLNP26678 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms