Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms