Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERCC2P18074 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERCC2P18074 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERCC2P18074 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms