Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DESP17661 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DESP17661 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DESP17661 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DESP17661 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DESP17661 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DESP17661 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DESP17661 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DESP17661 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DESP17661 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms