Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMP3P12645 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMP3P12645 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMP3P12645 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMP3P12645 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMP3P12645 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMP3P12645 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMP3P12645 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMP3P12645 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms