Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms