Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PKHD1P08F94 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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