Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F9P00740 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F9P00740 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms