Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD6O43541 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms