Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FABP7O15540 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FABP7O15540 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FABP7O15540 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FABP7O15540 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FABP7O15540 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FABP7O15540 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FABP7O15540 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FABP7O15540 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FABP7O15540 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FABP7O15540 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FABP7O15540 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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FABP7O15540 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FABP7O15540 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FABP7O15540 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FABP7O15540 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FABP7O15540 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FABP7O15540 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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