Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms