Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms