Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF839A8K0R7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms