Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
USP15Q9Y4E8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP15Q9Y4E8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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