Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms