Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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HDAC6Q9UBN7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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HDAC6Q9UBN7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HDAC6Q9UBN7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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