Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARHGAP28Q9P2N2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms