Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms