Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CMTM6Q9NX76 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms