Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms