Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms