Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSPNQ9HAW4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms