Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZCCHC2Q9C0B9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms