Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM5Q9C035 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms