Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR6

KRTAP3-3, Keratin-associated protein 3-3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-3Q9BYR6 TBC1D7-221ENST00000607658 1649 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC023830.2-201ENST00000563704 1662 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 BTN2A2-209ENST00000482536 1068 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 STAMBP-211ENST00000536064 845 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC048344.1-201ENST00000551974 407 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 RBM22P4-201ENST00000613117 1240 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 TOM1L1-210ENST00000572158 1521 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 AL512378.1-201ENST00000394808 2100 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP3-3Q9BYR6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms