Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013264.1-201ENST00000449346 455 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYB-AS1-201ENST00000455534 449 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093152.1-201ENST00000495684 564 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356235.1-202ENST00000506043 337 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00499-203ENST00000510736 587 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024270.1-201ENST00000559181 404 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBB-209ENST00000614404 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4Q2-202ENST00000622436 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM43B-202ENST00000639673 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GALM-201ENST00000272252 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM51FP-201ENST00000526452 1353 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590434.1-201ENST00000641402 1886 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP9-4Q9BYQ2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms