Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms