Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms