Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms