Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms