Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SLC16A9Q7RTY1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms