Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SV2AQ7L0J3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SV2AQ7L0J3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms