Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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USP43Q70EL4 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP43Q70EL4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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