Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms