Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HES3Q5TGS1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.2 ms