Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF2Q5BJF6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms