Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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