Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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