Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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DDB1Q16531 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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DDB1Q16531 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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DDB1Q16531 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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DDB1Q16531 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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DDB1Q16531 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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DDB1Q16531 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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DDB1Q16531 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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DDB1Q16531 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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DDB1Q16531 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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DDB1Q16531 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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DDB1Q16531 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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