Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6AP1Q15904 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms