Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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