Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC3Q14574 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms