Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIDRQ14159 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms