Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms