Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms