Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM28Q13263 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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