Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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