Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC10A2Q12908 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms