Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 CUEDC1-203ENST00000577422 547 ntTSL 311.4□□□□□ -0.587e-10■□□□□ 10.1
SF3A3Q12874 CUEDC1-213ENST00000585294 512 ntTSL 310.95□□□□□ -0.667e-10■□□□□ 10.1
SF3A3Q12874 CUEDC1-208ENST00000578357 661 ntTSL 38.72□□□□□ -1.017e-10■□□□□ 10.1
SF3A3Q12874 CUEDC1-210ENST00000581898 486 ntTSL 58.72□□□□□ -1.017e-10■□□□□ 10.1
SF3A3Q12874 CDK6-203ENST00000467166 779 ntTSL 26.62□□□□□ -1.357e-10■□□□□ 10.1
SF3A3Q12874 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.722e-8■□□□□ 10
SF3A3Q12874 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.91e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.611e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 01e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 ERBB3-210ENST00000549472 519 ntTSL 511.77□□□□□ -0.534e-7■□□□□ 10
SF3A3Q12874 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.711e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.996e-7■□□□□ 10
SF3A3Q12874 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.274e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.564e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 THOC5-201ENST00000358079 2427 ntTSL 510.44□□□□□ -0.744e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 THOC5-209ENST00000442555 3012 ntTSL 29.82□□□□□ -0.844e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 THOC5-210ENST00000443089 786 ntTSL 29.16□□□□□ -0.944e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.994e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 THOC5-214ENST00000484924 909 ntTSL 57.32□□□□□ -1.244e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.384e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 THOC5-217ENST00000492707 550 ntTSL 34.72□□□□□ -1.654e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 STARD3-210ENST00000577248 571 ntTSL 416.7■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 STARD3-222ENST00000583419 579 ntTSL 414.16□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 CERS2-206ENST00000421609 738 ntTSL 321.97■■□□□ 1.112e-12■□□□□ 10
SF3A3Q12874 CERS2-211ENST00000559020 594 ntTSL 412.9□□□□□ -0.342e-12■□□□□ 10
SF3A3Q12874 TBCK-215ENST00000509532 848 ntTSL 510.42□□□□□ -0.744e-8■□□□□ 10
SF3A3Q12874 TBCK-210ENST00000506280 532 ntTSL 54.46□□□□□ -1.74e-8■□□□□ 10
SF3A3Q12874 DLG5-208ENST00000476354 1198 ntTSL 214.88□□□□□ -0.038e-7■□□□□ 10
SF3A3Q12874 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.346e-9■□□□□ 10
SF3A3Q12874 EVA1A-211ENST00000490746 589 ntTSL 515.57■□□□□ 0.086e-9■□□□□ 10
SF3A3Q12874 EVA1A-206ENST00000432649 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.14■□□□□ 0.016e-9■□□□□ 10
SF3A3Q12874 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.066e-9■□□□□ 10
SF3A3Q12874 EVA1A-208ENST00000485891 479 ntTSL 514.18□□□□□ -0.146e-9■□□□□ 10
SF3A3Q12874 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.36e-9■□□□□ 10
SF3A3Q12874 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.546e-9■□□□□ 10
SF3A3Q12874 EVA1A-207ENST00000452003 434 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.63□□□□□ -0.876e-9■□□□□ 10
SF3A3Q12874 EVA1A-210ENST00000486696 585 ntTSL 36.73□□□□□ -1.336e-9■□□□□ 10
SF3A3Q12874 TBCK-204ENST00000394708 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.791e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 TBCK-206ENST00000467183 3566 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.871e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 10
SF3A3Q12874 PHKA2-202ENST00000464455 500 ntTSL 34.07□□□□□ -1.768e-14■□□□□ 10
SF3A3Q12874 TBCK-217ENST00000510927 2826 ntTSL 25.45□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 VARS2-204ENST00000467717 863 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 VARS2-203ENST00000428017 1103 ntTSL 214.17□□□□□ -0.141e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 ZNF512-206ENST00000488055 2465 ntTSL 27.05□□□□□ -1.282e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 POLR2A-204ENST00000575547 702 ntTSL 35.59□□□□□ -1.512e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-78■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 214.57□□□□□ -0.082e-78■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 36.95□□□□□ -1.32e-78■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SLC39A5-208ENST00000447080 380 ntTSL 519.03■□□□□ 0.641e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SLC39A5-203ENST00000419232 833 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.643e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.63e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MARS-204ENST00000545888 2979 ntTSL 516.21■□□□□ 0.198e-20■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.188e-20■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.118e-20■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MARS-203ENST00000537638 3592 ntTSL 215.19■□□□□ 0.028e-20■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MARS-215ENST00000548944 294 ntTSL 312.24□□□□□ -0.458e-20■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MARS-222ENST00000551172 699 ntTSL 37.96□□□□□ -1.148e-20■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MARS-230ENST00000552914 734 ntTSL 36□□□□□ -1.458e-20■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MARS-229ENST00000552499 555 ntTSL 35.13□□□□□ -1.598e-20■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MARS-209ENST00000547665 670 ntTSL 24.18□□□□□ -1.748e-20■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.418e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RTKN-206ENST00000469859 496 ntTSL 315.15■□□□□ 0.022e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.53e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.742e-12■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.371e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.371e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.283e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.271e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SLC35B2-203ENST00000495706 1859 ntTSL 322.94■■□□□ 1.261e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.195e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.185e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 UBAP2L-209ENST00000437652 911 ntTSL 322.41■■□□□ 1.181e-13■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 WBP1-207ENST00000466835 739 ntTSL 522.33■■□□□ 1.173e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.143e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 WBP1-204ENST00000428943 989 ntTSL 522.13■■□□□ 1.133e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 WBP1-209ENST00000473467 847 ntTSL 221.91■■□□□ 1.13e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 WBP1-206ENST00000466303 817 ntTSL 321.86■■□□□ 1.093e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.073e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 UBAP2L-205ENST00000412596 980 ntTSL 521.61■■□□□ 1.051e-13■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.033e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 WBP1-211ENST00000484744 2047 ntTSL 221.47■■□□□ 1.033e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 EP400-202ENST00000332482 2588 ntTSL 1 (best)21.05■□□□□ 0.965e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.923e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 520.71■□□□□ 0.913e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.93e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.93e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SH2B1-208ENST00000563591 588 ntTSL 220.59■□□□□ 0.891e-8■□□□□ 9.9
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